El negocio de los secuenciadores de ADN


La secuenciación consiste en determinar el orden de las unidades químicas de ADN, que se conocen como bases y por lo general están representados por las letras A, C, G y T. El orden de estas bases ayuda a determinar rasgos heredados, como la susceptibilidad a algunas enfermedades.

La secuenciación del ADN se está convirtiendo en  algo  rápido , más barato. y ahora, también es cada vez más pequeño.

La secuenciacion  de ADN podría ayudar a los médicos a secuenciar genes en la cama de un paciente, los biólogos de vida silvestre para estudiar los genes en el campo, o los inspectores de alimentos para identificar los agentes patógenos.“Usted no tiene que comprar los instrumentos,” Clive G. Brown, el director de tecnología de la empresa, Oxford Nanopore Technologies, dijo en una entrevista. “Es pay-as-you-go de secuenciación”.

 Universidad de Oxford

Una compañía británica de hecho ha anunciado recientemente  que a finales del año comenzaría a vender un dispositivo de secuenciación de genes desechable que es del tamaño de un lápiz de memoria USB y se conecta a un ordenador portátil para entregar sus resultados.El dispositivo, que se espera que cuestan menos de $ 900, podría permitir a pequeños trabajos de secuenciación a ser realizados por investigadores que no pueden pagar los $ 50.000 a 750.000 dólares necesarios para comprar una máquina de secuenciación.

Oxford presentó detalles del dispositivo, así como de un nuevo secuenciador, algo más grande que también planea comenzar a vender a finales de este año, a los avances en Genome Biology y conferencia de tecnología en Marco Island, Florida., Que se ha convertido en la industria de secuenciación alarde festival anual.

Tanto la pequeña Minion y el mayor GridIon ven probable que sean los primeros secuenciadores para utilizar la secuenciación de nanoporos, en el que se lee una cadena de ADN, ya que se tira a través de un agujero microscópico, como una especie de fideos se sorbió con los labios redondeados.

En 2009, invirtió $ 18 millones en Oxford Nanopore, y es dueño de una participación de 15 por ciento. Pero Illumina no tiene los derechos de comercialización a las máquinas . Más bien, tiene el derecho a una tecnología de Oxford alternativa que está más atrás en el desarrollo.Illumina acciones cayeron casi un 4 por ciento el viernes para 51,82 dólares, mientras que las acciones de la vida cayeron casi un 8 por ciento, a 45,92 dólares.

A medida que el costo se desploma, la secuenciación está pasando de los laboratorios de investigación en la atención al paciente. Algunos de cáncer de centros, por ejemplo, genes de secuencia para determinar los mejores medicamentos para su uso.

La creciente importancia de la secuenciación en la atención médica se lo que motivó a Roche para hacer su actual $ 5700 millones oferta hostil para adquirir Illumina .Conocido sobre todo para los productos farmacéuticos , Roche también tiene un negocio de diagnóstico de gran tamaño.

Secuenciación de nanoporos es fácil de imaginar, pero ha sido engañosamente difícil de llevar a cabo, a pesar de dos décadas de investigación por universidades y empresas.

Oxford, que se celebra y se basa en la tecnología desarrollada por un profesor de la Universidad de Oxford en privado, utiliza poros elaborados a partir de proteínas bacterianas. Una corriente eléctrica fluye a través del poro. Las bases interrumpen la corriente en diferentes formas a medida que avanzan a través de este.

Las máquinas iniciales GridIon tendrán 2.000 poros pero mas adelante  tendrán 8.000 poros.

Una gran ventaja de la secuenciación de nanoporos, Dr. de la Universidad de Washington Mardis dijo, es que la preparación de la muestra es rápido y fácil. La tecnología también ofrece la promesa de ser capaz de leer decenas de miles de bases en un tramo. La mayoría de los secuenciadores leer desde alrededor del 30 a unos cuantos miles de bases de un tirón, y estos pequeños fragmentos entonces tendrá que ser reconstruido.

Un inconveniente es que la máquina Oxford tiene una tasa de error de 4 por ciento, demasiado alta para muchas aplicaciones, incluyendo el diagnóstico.

El siervo, mientras que conlleva ningún costo de capital para una máquina, se puede utilizar una sola vez y será secuenciar hasta mil millones de bases. Eso es un costo de hasta $ 1,000 por cada mil millones de bases.

Un GridIon podría costar alrededor de $ 30.000, dijeron ejecutivos de Oxford. La compañía dijo que si se utilizaron 20 de los GridIons de segunda generación en conjunto, un genoma humano podría ser secuenciado en 15 minutos a un costo de alrededor de $ 1.500.

Para entonces, sin embargo, las máquinas rivales podrían ser capaces de hacer que los genomas de coste o incluso menos. Ion Torrent, una subsidiaria de Life Technologies, anunció el mes pasado que estaba desarrollando una máquina que pudiera hacer un genoma humano en un día por $ 1.000.

 

 

Universidad de Otago

Un dispositivo de diagnóstico revolucionario de mano y de baterías de ADN inventado en la Universidad de Otago está a punto de convertirse en una herramienta de campo de uso común para la detección rápida de sospechosos de virus o bacterias en las muestras a la vez que la determinación del nivel de infección.

El dispositivo de avance, apodado Freedom4, se aprovecha de una tecnología llamada PCR cuantitativa para identificar secuencias de ADN diana, en tiempo real, sin necesidad de procesamiento adicional.

Como ejemplo, usando Freedom4, la presencia y extensión de la infección por norovirus en una muestra se pudo confirmar en menos de una hora, mientras que la persona que utiliza la unidad estaba todavía en el sitio de brote.

Dr. Jo-Ann Stanton, quien dirigió el programa para desarrollar el dispositivo, dice que además de permitir ‘en cualquier momento y en cualquier lugar “diagnóstico clínico de enfermedades infecciosas virales en humanos y animales, sino que también tiene muchos otros usos potenciales, como la seguridad fronteriza, argumentación y monitoreo ambiental.

Desarrollado por el equipo multidisciplinario del Dr. Stanton en el Departamento de Anatomía de Otago, la unidad robusta pesa lo mismo que un portátil normal y cabe en la palma de su mano ( es del tamaño similar a un ladrillo) . Freedom4 cuenta con una duración de la batería de seis horas y puede ser atado a un ordenador portátil o conectarse de forma inalámbrica a teléfonos inteligentes o tabletas que ejecutan el software personalizado que analiza e interpreta los resultados de la prueba.

“Esta movilidad podría proporcionar una gran ayuda para los agricultores. Por ejemplo, los veterinarios pueden conducir por una granja de análisis de muestras de varios lugares, hacer sus diagnósticos y tratar a los animales -todos infectados en un solo viaje “, dice ella.

Un prototipo del dispositivo se ha puesto de forma independiente a través de sus pasos por el Instituto de Nueva Zelanda de Medio Ambiente e Investigación Científica. Después de ejecutar ensayos para E. coli productora de toxina, y varios gastrointestinal y los virus respiratorios, incluyendo H1N1-Freedom4 fue encontrado para llevar a cabo a la par con los sistemas de análisis del ADN basadas en el laboratorio mucho más grandes.

Dr. Stanton dice que ella y su equipo están encantados de que su proyecto de seis años para hacer un dispositivo de diagnóstico de mano de punto de atención en una realidad ha llegado a buen término.

“Estamos inmensamente orgullosos de que hemos creado este dispositivo brillante; actualmente no existe ningún otro sistema en el mundo que se compara en términos de la potencia analítica que hemos logrado en este nivel de movilidad y facilidad de uso “.

El equipo del Dr. Stanton incluye un físico, programador de computadoras, un químico y biólogos. Su proyecto fue financiado a través de un nuevo Fondo de Investigación de Economía (NERF) a partir de lo que hoy es el Ministerio de Negocios, Innovación y Empleo. NERF objetivos incluyen la investigación básica iniciada por el investigador de apoyo que tiene el potencial para crear las plataformas tecnológicas avanzadas que servirán de base a industrias nuevas y emergentes.

Brazo de comercialización de la universidad, Otago Innovación, ahora está trabajando para hacer girar la tecnología en asociación con una empresa de Nueva Zelanda llamado Ubiquitome .

Mayor Comercialización Gerente David Christensen de Otago Innovación dice que el desarrollo de Freedom4 ejemplifica la investigación universitaria siendo traducido con éxito en la tecnología del mundo real con un enorme potencial para la salud, económico y beneficios medioambientales.

“Dr. Stanton y sus colegas han utilizado su experiencia multidisciplinar combinado para superar una serie de desafíos técnicos enormes proporciones para crear un dispositivo de diagnóstico molecular que es realmente líder en el mundo,” dice el Sr. Christensen.Es otro gran ejemplo de la transferencia de tecnología de la Universidad de Otago, dice.

“Estamos encantados de ser parte de Ubiquitome ya que trabaja para hacer realidad su sueño de conectar el mundo de la información genómica significativa a través de mano, cloud-conectado dispositivos de análisis genéticos.”

 

fuente   aqui y aqui

Navegadores para Android sin conexion


Con la  aplicación Google Maps para teléfonos y tablets Android, navegar por el mundo  nunca ha sido  tan fácil  y barato  , pues hoy en día es raro encontrar un  smartphone sin gps  ni tarifa de  datos. Gracias  a  esta aplicación completamente  gratuita   puede  descubrir los mejores sitios de la ciudad y obtener la información que necesita para llegar a  cualquier parte , sin que le cueste un céntimo.

Esta app, con casi 5 milones de descargas, no nos sorprende  que sea las mas descargada en Google play , pues entre otras cosas  posee las siguientes características:

  •  Mapas completos y precisos en 220 países y territorios
  •  Navegación GPS por voz para llegar en coche, en bici y a pie
  •  Indicaciones de transporte público y mapas de más de 15.000 pueblos y ciudades
  •  Estado del tráfico en tiempo real, informes de incidentes y modificación automática de rutas para encontrar la mejor opción
  •  Información detallada sobre más de 100 millones de sitios
  •  Imágenes de interior y de Street View de restaurantes, museos y mucho más
  •  Algunas funciones no están disponibles en todos los países.

 

A continuación presentamos las diferentes opciones :

1-Obtener indicaciones detalladas de navegación: Llegue  fácil y rápidamente a cualquier lugar con las indicaciones por voz paso a paso. Reciba indicaciones paso a paso tanto si está caminando como si va conduciendo o en transporte público de este modo:

  1. Abra la aplicación Google Maps Google Maps app logo image.
  2. Obtéga indicaciones para llegar a una ubicación.
  3. Toque el icono de Navigation Navigation start icon para escuchar indicaciones por voz paso a paso.

Para salir de la navegación, toque  la “X” situada en la esquina superior derecha de la pantalla. Mientras utiliza Navigation, puede seguir utilizando el teléfono y otras aplicaciones

Sugerencia: Si sale de Navigation y pierde la conexión de datos, puede volver rápidamente a Navigation si aún se encuentras cerca (menos de 3 km) de la ruta original a su destino:

  1. Toque el cuadro de búsqueda situado en la parte superior o el icono de indicaciones directions button image en la esquina inferior derecha.
  2. Verá una tarjeta indicando su destino anterior. Toca la tarjeta para iniciar las indicaciones.
  3. Toca el icono de Navigation Navigation start icon para escuchar indicaciones por voz paso a paso.

2-Controlar Navigation con la voz : Puedes utilizar tu voz para controlar Navigation en tu teléfono o tablet Android. Si te vas a desplazar a algún sitio, toca el icono de micrófono Navigation microphone button icon en la esquina superior derecha de la pantalla y di lo que quieres que haga Navigation. Más información sobre los comandos de voz de Navigation

3-Iniciar rápidamente la navegación detallada :Seleccione un sitio y, a continuación, mantén pulsado el icono de transporte. Se activará automáticamente la navegación GPS paso a paso guiada por voz y podrás ponerte en marcha.

4-Seguir su ruta :En la navegación paso a paso, el mapa se mueve para mostrar tu progreso a lo largo de la ruta. Si mueves, giras, inclinas o haces zoom en el mapa, puedes volver a ver tu progreso tocando Reanudar en la parte inferior de la pantalla.

5Ver una lista de indicaciones paso a paso:Para ver una lista de indicaciones paso a paso, toca la hoja situada en la parte inferior de la pantalla o tira de ella hacia arriba.

Para volver a la vista de mapa, tire de la hoja hacia abajo hasta la parte inferior de la pantalla.

6Cambiar de ruta :Las rutas alternativas aparecerán en color gris en el mapa. Puede seleccionar una ruta diferente en cualquier momento.

  1. Una vez que haya accedido a Navigation, toca el icono de ruta alternativa situado en la esquina inferior derecha de la pantalla del dispositivo.
  2. Seleccione la ruta alternativa que prefiera.
  3. Navigation iniciará inmediatamente el recorrido correspondiente a esa ruta.

7-Indicaciones y vista previa de ruta:Puede ver el resto del recorrido deslizando hacia la izquierda la barra de direcciones verde situada en la parte superior de la pantalla. El siguiente paso aparecerá en verde y los demás en gris. Para volver al paso actual de las indicaciones, pulsa el botón Continuar.También puedes consultar una vista previa de la ruta reduciendo la imagen varias veces durante el recorrido.

8-Indicación de carril :Navigation puede ayudarle cuando se aproximas a una intersección o a una salida con varios carriles. Las indicaciones por voz y las indicaciones paso a paso te sugieren los carriles más adecuados para tu ruta.cNota: La función de indicación de carril solo está disponible en algunas regiones y en algunos idiomas.

9-Tiempo hasta el destino :En la parte inferior de la pantalla, podrás consultar rápidamente el tiempo aproximado que te falta para llegar a tu destino. El color del tiempo (rojo, amarillo o verde) dependerá del estado del tráfico en ese momento a lo largo de la ruta. Si los datos del tráfico no están disponibles, el tiempo hasta el destino aparecerá en gris.

También puede ver el tiempo aproximado que falta para llegar al destino y la distancia que queda por recorrer en la parte inferior de la pantalla.Para cambiar de millas a kilómetros (y viceversa), siga estos pasos:

  1. Abra la aplicación Google Maps Google Maps app logo image.
  2. Vaya al menú y toca Ajustes > Unidades de distancia.
  3. Seleccione la unidad que prefieras.

10-Obtener indicaciones mientras utilizs otras aplicaciones :Puede obtener indicaciones mientras utilizas otras aplicaciones. Recibirá indicaciones por voz y podrás consultar el próximo paso deslizando hacia abajo el panel de notificaciones.

  1. Toque la parte superior de la pantalla y deslízala hacia abajo para abrir el panel de notificaciones.
  2. Busque el símbolo . Debajo de este símbolo aparecerá la próxima indicación, así como otra información útil.

 

Link de  descarg aen Google Plya de Google Maps aqui

 

Pero  como se comentaba  a  pesar de las grandes bondades  , Google Map  posee un talón de aquiles : navegar en modo offline ya que, aunque nos deja guardar porciones de mapa en nuestro dispositivo, si viajamos en un lugar con mala cobertura  de datos  o  al extranjero y no contamos con datos móviles, nos encontraremos con que el navegador no funcionará  ya que necesita de una conexión para trazar el mejor recorrido .Así que cuando llega ese problema, lo mejor es tener a mano un navegador que nos permita acceder a los mapas y a sus rutas completamente offline, sin necesidad de datos 3G, 4G o Wifi al estilo  de los navegadores GPS    dedicados   que hasta hace muy poco copaban el mercado

Aunque hemos hablado en mas de una ocasión en este blog  de estos ,   vamos  a hacer un pequeño resumen de las diferentes opciones  para Android de navegadores que permitan navegación  offline (es decir sin necesitar una conexión de datos:

 

  • HERE Maps :La solución gratuita   de Nokia promete una funcionalidad perfecta para navegar offline ya que entre sus muchas virtudes está la de bajarnos cualquier mapa del rincón que sea del mundo gratis: Europa, EE.UU., Asia, África, etc. Además, cuenta con vistas normales o de satélite muy detalladas. Se encuentra todavía en fase de Beta por lo que en el link de descarga    se ofrece el APK ddirectamente desde la web de su desarrollador( no esta aun en google play)   .Descarga: Here Maps
  •  Sygic :Cuenta con mapas de mucha calidad gráfica, detallados y en 3D, que representan las principales ciudades del mundo.Aunque es gratis su descarga, los  mapas se pagan aparte pero  sus actualizaciones son de vida . Tiene una muy buena opción que recuerda todas nuestras rutas anteriores, por si queremos repetir alguna tiempo más tarde Como   aspecto muy innovador destaca el modo reflejo en el parabrisas   del que tratamos .Descarga: Sygic
  • NavFree :Es un navegador 100% orientado a llevarlo en el coche y recibir las indicaciones ‘paso a paso’ de la ruta que hemos marcado. Eso sí, si lo queremos utilizar cuando vamos de paseo haciendo turismo por otra ciudad, podremos configurarlo en modo peatón para seguir recibiendo las indicaciones que sean.Descarga: NavFree
  • OsmAnd Maps & Navigation :OsmAnd es un navegador que cuenta con unos mapas muy detallados que obtiene de OpenStreetMap (OSM) y nos permite en su versión completamente gratuita descargarnos un máximo de 10 mapas, Si necesitáramos más, tendríamos que pagar una cantidad que no es muy importante. Eso sí, como la mayoría de estos navegarores, cuenta con tipos de búsqueda por POI (puntos de interés), dirección, coordenadas, favoritos, histórico, etc.Descarga: OsmAnd Maps & Navigation
  • MapDroyd:Esta aplicación también se sirve de los mapas de OpenStreetMap (OSM) y son gratis su descarga. Además, nos garantizan que cada cuatro o seis semanas toda esta información se actualiza con datos de POI (puntos de interés), etc. Podremos realizar rutas aplicando distintos criterios como el de los códigos postales, que nos permite saber el de la zona por la que circulamos o el del lugar hacia el que nos dirigimos.Descarga: MapDroyd