Para empezar  debe antes haber realizado la instalación del  tinybooterdecompressor  en su Netduino , par lo cula puede mirar  en esta guía :https://soloelectronicos.wordpress.com/2013/03/01/instalacion-del-tinybooterdecompressor-paso-a-paso-netduino-y-plus-netduino/

Para flashear su Netduino de la versión  4,1 a la  4,2 se debe actualizar tanto el gestor de arranque  aquí .NET Micro Framework SDK v4.2 como el driver  Netduino SDK v4.2.2.0 (32-bit) o
Netduino SDK v4.2.2.0 (64-bit) segun corresponda

Ahora debe  arrancar el programa  MFDeploy, pulsando  en Inicio-> Microsoft  .Net Framework 4.2 –>Tools.

Seleccione en Device » USB» y a la derecha  su versión de  Netduino y haga clic en «Ping» para verificar que el dispositivo esté disponible:

En este punto obtenga el nuevo firmware  en función de su versión de Netduino  aquí :http://wiki.netduino.com/Firmware.ashx

Ahora haga clic en «Examinar» y seleccionar tanto el ER_CONFIG y archivos ER_FLASH. (Mantenga presionada la tecla «Ctrl» para seleccionar el segundo archivo)
Si lo desea, puede elegir sólo «ER_FLASH» para actualizar sólo el firmware. Si decide subir el archivo ER_CONFIG, y usted tiene un Netduino Plus, usted tendrá que restablecer la dirección MAC de su dispositivo, vaya a la opción de menú Target-> Configuración.

Cuando los dos archivos seleccionados se  hayan seleccionado , haga clic en Implementar.

Esto podria  tomar un tiempo(cinco minutos o así) …

Una vez que finalice el despliegue, retire y vuelva a colocar su Netduino mediante el cable microUSB para completar la operación de flash.

Después de parpadear y reiniciar el Netduino, ahora puede comprobar la versión del firmware actual seleccionando la opción «Target-> Capacidades de dispositivos» del menú del MDFDEploy:

La respuesta seria algo así:

  SolutionReleaseInfo.solutionVersion: 4.2.0.0

 SolutionReleaseInfo.solutionVendorInfo: Netduino (v4.2.0.0 b1) por Secret Labs LLC